快递公司收取偏远地区附加费主要是由于以下几个原因：
首先，偏远地区的配送成本相对较高。由于这些地区地理位置偏远，交通不便，道路条件较差，快递员需要花费更多的时间和精力来配送包裹。此外，偏远地区的经济相对不发达，人口密度较低，这意味着快递公司在这些地区难以实现规模经济，每单的运营成本自然较高。
其次，快递公司在偏远地区的网络覆盖和基础设施相对薄弱。为了在这些地区提供服务，快递公司需要投入大量资金来建设仓库、购买车辆、培训快递员等，这些投资都需要通过附加费来回收。此外，偏远地区的网络覆盖和基础设施薄弱也导致快递公司在这些地区的运营效率较低，进一步增加了运营成本。
再次，快递公司在偏远地区的客户密度较低，难以实现盈利。由于客户密度低，快递公司在偏远地区的订单量相对较少，难以通过订单量来分摊运营成本。因此，为了实现盈利，快递公司不得不通过收取附加费来弥补损失。
最后，政府政策的影响也是导致快递公司收取偏远地区附加费的原因之一。一些政府政策要求快递公司必须提供全国范围内的配送服务，即使在一些偏远地区。这些政策虽然保障了偏远地区的居民能够享受到快递服务，但也增加了快递公司的运营成本。为了弥补这些成本，快递公司不得不通过收取附加费来平衡收支。
综上所述，快递公司收取偏远地区附加费主要是由于配送成本较高、网络覆盖和基础设施薄弱、客户密度低以及政府政策的影响。这些因素共同导致了快递公司在偏远地区的运营成本较高，为了实现盈利，不得不通过收取附加费来弥补损失。