PCIe网卡和USB网卡在性能方面各有优势，具体选择取决于应用场景和需求。PCIe网卡通常提供更高的传输速度和更低的延迟，适合需要高带宽和稳定性的应用，如高性能计算、视频编辑和大型数据传输。PCIe（Peripheral Component Interconnect Express）是一种高速串行计算机扩展总线标准，其数据传输速率远高于USB，尤其是在PCIe 3.0及以上版本中，其带宽可以达到数十GB/s。
相比之下，USB网卡虽然安装和使用更为灵活，适合普通用户和移动设备，但其传输速度通常较低。USB 3.2标准提供高达10Gbps的传输速率，但与PCIe相比仍有较大差距。USB网卡更适合对速度要求不高的应用，如家庭网络共享、普通文件传输等。
此外，PCIe网卡通常需要安装在计算机的主板上，而USB网卡则通过USB接口连接，无需打开机箱。这也使得USB网卡在便携性和易用性上具有优势。
在选择时，还需考虑兼容性、功耗和成本等因素。PCIe网卡通常更贵，且需要更多的电源支持，而USB网卡则相对便宜且易于更换。