睡眠不足时，眼睛会感到酸痛，这是因为眼睛在长时间工作后没有得到充分的休息。正常情况下，人在睡眠过程中，眼部肌肉和组织能够放松并恢复活力。如果睡眠不足，眼睛无法完成自我修复的过程，导致眼部肌肉疲劳、干涩以及酸胀感。
此外，睡眠不足会影响泪液分泌和分布，使眼球表面得不到足够的润滑，进一步加重眼睛干涩和不适的感觉。长期缺乏睡眠还可能引发眼部炎症或加重已有的眼部疾病。